22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1447 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3879  hypothetical protein  85.6 
 
 		 617 aa  1115    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3531  hypothetical protein  53.41 
 
 		 645 aa  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115281 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1266  YjhS  55.24 
 
 		 621 aa  663    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0323184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1447  YjhS  100 
 
 		 618 aa  1280    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1168  hypothetical protein  83.63 
 
 		 616 aa  1092    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3214  hypothetical protein  53.46 
 
 		 648 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0279968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1852  hypothetical protein  53.46 
 
 		 648 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0338393  hitchhiker  0.0000000502034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2188  hypothetical protein  85.25 
 
 		 616 aa  1110    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.162911  hitchhiker  0.0000018311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2258  hypothetical protein  85.58 
 
 		 616 aa  1113    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000616827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2790  hypothetical protein  83.79 
 
 		 616 aa  1093    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.578932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2904  hypothetical protein  55.73 
 
 		 645 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148641  hitchhiker  0.0000000129832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3147  hypothetical protein  53.15 
 
 		 648 aa  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.05246  hitchhiker  0.000000000290208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2192  YjhS  62.96 
 
 		 462 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000609291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5813  hypothetical protein  57.72 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.358202 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3689  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  58.49 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04138  hypothetical protein  58.49 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4908  hypothetical protein  58.18 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4534  hypothetical protein  57.1 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04176  hypothetical protein  58.49 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4834  hypothetical protein  57.23 
 
 		 326 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1524  YjhS  47.24 
 
 		 430 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2555  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.84 
 
 		 264 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880484  normal  0.133865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>