18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3550 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3550  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  243  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1821  hypothetical protein  30.36 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338762  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1229  phaR protein  27.52 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.705395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1404  phaR protein  27.52 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1469  phaR protein  27.52 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1657  hypothetical protein  24.59 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.921397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1329  phaR protein  27.52 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1208  PHA synthase subunit PhaR; regulator of PhaP  27.52 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00647485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1428  phaR protein  27.52 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1206  PHA synthase subunit PhaR; regulator of PhaP  27.52 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1367  phaR protein  27.52 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.152883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3977  phaR protein  27.52 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3644  hypothetical protein  25.44 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1230  polyhydroxyalkanoic acid synthase, PhaR subunit  26.61 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1042  polyhydroxyalkanoic acid synthase, PhaR subunit  25.69 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4292  hypothetical protein  26.32 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000022825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2862  hypothetical protein  24.51 
 
 		 263 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0433683  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2543  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  36.05 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00882865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>