63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2357 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2357  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  261  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.293162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5046  hypothetical protein  48.46 
 
 
141 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0178829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3809  protein of unknown function DUF350  44.26 
 
 
132 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04013  hypothetical protein  44.26 
 
 
132 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5700  putative inner membrane protein  44.26 
 
 
132 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4655  putative inner membrane protein  44.26 
 
 
132 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.698141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3829  hypothetical protein  44.26 
 
 
132 aa  107  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4744  putative inner membrane protein  44.26 
 
 
132 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4428  putative inner membrane protein  44.26 
 
 
132 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04051  conserved inner membrane protein  44.26 
 
 
132 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4714  putative inner membrane protein  43.44 
 
 
132 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5123  protein of unknown function DUF350  43.31 
 
 
132 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331318  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4660  hypothetical protein  43.31 
 
 
132 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4651  inner membrane protein YjfL  41.27 
 
 
132 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4771  inner membrane protein YjfL  41.27 
 
 
132 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.888513  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4792  hypothetical protein  41.27 
 
 
132 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4735  inner membrane protein YjfL  41.27 
 
 
132 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482474  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4642  inner membrane protein YjfL  41.27 
 
 
132 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5365  hypothetical protein  40.77 
 
 
133 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5201  protein of unknown function DUF350  42.52 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0441  hypothetical protein  46.46 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.933561  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5277  protein of unknown function DUF350  38.35 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.475083  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02188  hypothetical protein  40.32 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3753  hypothetical protein  39.68 
 
 
133 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5549  protein of unknown function DUF350  37.59 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.848106 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003908  membrane protein  33.58 
 
 
138 aa  89.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3599  protein of unknown function DUF350  40.98 
 
 
132 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3442  hypothetical protein  40.98 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3782  hypothetical protein  42.74 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6548  hypothetical protein  39.84 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01616  hypothetical protein  33.58 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1221  hypothetical protein  38.76 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2240  protein of unknown function DUF350  37.6 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4233  protein of unknown function DUF350  40.74 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3913  hypothetical protein  40.3 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.872906  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4121  protein of unknown function DUF350  40.74 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.580864  normal  0.0514139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1696  hypothetical protein  43.55 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01337  hypothetical protein  36.43 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5567  protein of unknown function DUF350  40.98 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4279  hypothetical protein  40.95 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0188  hypothetical protein  39.62 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.510986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3460  hypothetical protein  42.31 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1314  hypothetical protein  34.13 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00268804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5403  hypothetical protein  40.19 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739219  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3303  hypothetical protein  37.04 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164072  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05342  hypothetical protein  41.67 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.873206  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0817  hypothetical protein  34.45 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.082811  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1401  hypothetical protein  36.07 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3474  hypothetical protein  33.61 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4892  hypothetical protein  33.61 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487798  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5394  hypothetical protein  33.61 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593541  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1502  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.828357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3705  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00316212  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4799  hypothetical protein  35.29 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393572  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4272  hypothetical protein  33.62 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1751  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000355487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1459  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1640  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1673  hypothetical protein  32.26 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1603  hypothetical protein  32.26 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1487  hypothetical protein  32.26 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1460  hypothetical protein  32.26 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1785  protein of unknown function DUF350  29.63 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>