57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0431 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0431  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  211  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3910  hypothetical protein  63.83 
 
 
98 aa  120  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0340  hypothetical protein  67.37 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0442242  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0609  hypothetical protein  58.76 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2033  hypothetical protein  61.96 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2871  protein of unknown function DUF1244  54.26 
 
 
102 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0988  hypothetical protein  52 
 
 
100 aa  103  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0124  hypothetical protein  60.76 
 
 
102 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1688  hypothetical protein  59.77 
 
 
103 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19610  hypothetical protein  60.71 
 
 
103 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0327  protein of unknown function DUF1244  52.22 
 
 
100 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0421586  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0510  hypothetical protein  51.09 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10250  hypothetical protein  51.52 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2749  hypothetical protein  55.56 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0621  hypothetical protein  61.54 
 
 
99 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0910  hypothetical protein  54.12 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.481473  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2363  deoxycytidine triphosphate deaminase  52.38 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0212261  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0226  protein of unknown function DUF1244  52.75 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2976  protein of unknown function DUF1244  55.56 
 
 
102 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0445  hypothetical protein  51.06 
 
 
98 aa  97.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1220  hypothetical protein  51.09 
 
 
100 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.699569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5967  protein of unknown function DUF1244  53.93 
 
 
101 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4671  protein of unknown function DUF1244  48.96 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2679  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.701698  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3291  hypothetical protein  56.63 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2137  hypothetical protein  50.56 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.643162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6867  hypothetical protein  51.58 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0188291  normal  0.0230228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4494  hypothetical protein  56.79 
 
 
97 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1918  hypothetical protein  54.76 
 
 
106 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1018  hypothetical protein  54.12 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0940  hypothetical protein  51.72 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0505  protein of unknown function DUF1244  52.27 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1404  hypothetical protein  51.09 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4633  hypothetical protein  56.79 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115791  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1425  hypothetical protein  47.92 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0889  hypothetical protein  56.79 
 
 
120 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00903  hypothetical protein  55.56 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00704885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1180  hypothetical protein  52.94 
 
 
98 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.887968  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0807  hypothetical protein  52.94 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18487  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0179  hypothetical protein  48.94 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4618  hypothetical protein  55.56 
 
 
98 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5201  hypothetical protein  53.09 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3253  hypothetical protein  51.28 
 
 
94 aa  90.1  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2828  hypothetical protein  53.09 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2333  hypothetical protein  57.53 
 
 
92 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3170  hypothetical protein  46.32 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01819  Deoxycytidine triphosphate deaminase  53.01 
 
 
97 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0173168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3292  protein of unknown function DUF1244  51.9 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1293  hypothetical protein  51.85 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398704  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1761  hypothetical protein  54.32 
 
 
109 aa  87.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.530728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3693  hypothetical protein  48.84 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3593  protein of unknown function DUF1244  50.63 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22377  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1647  hypothetical protein  47.78 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.205774  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004018  protein of unknown function DUF1244  46.94 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01447  hypothetical protein  46.94 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6558  protein of unknown function DUF1244  58.33 
 
 
81 aa  83.6  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.45897  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1549  hypothetical protein  45.16 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00160106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>