17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4667 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4667  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  283  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419018  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4079  conserved hypothetical membrane spanning protein  42.5 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175719  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2153  hypothetical protein  42.4 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0171  hypothetical membrane spanning protein  38.74 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1934  hypothetical protein  33.55 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2023  hypothetical protein  45.9 
 
 
209 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2626  hypothetical protein  37.63 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.817414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2816  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.45 
 
 
612 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0322  conserved hypothetical membrane spanning protein  36.6 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  29.05 
 
 
515 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0929  histidine kinase  33.33 
 
 
564 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4504  hypothetical protein  34.41 
 
 
188 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.202834  normal  0.0175387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4505  hypothetical protein  31.78 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.890484  normal  0.0392593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0870  hypothetical protein  37.36 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000832206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0869  hypothetical protein  32.61 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0086  hypothetical protein  36.89 
 
 
290 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0507889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1125  hypothetical protein  32.85 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.310685  normal  0.848341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>