13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4439 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4046  hypothetical protein  71.86 
 
 
799 aa  1058    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.850338  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4439  hypothetical protein  100 
 
 
827 aa  1605    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041911  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1266  hypothetical protein  42.98 
 
 
990 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1072  hypothetical protein  39.53 
 
 
704 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9101  hypothetical protein  33.84 
 
 
309 aa  155  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04050  hypothetical protein  37.09 
 
 
309 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0246073  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0470  hypothetical protein  31.97 
 
 
426 aa  99  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1596  hypothetical protein  33.55 
 
 
771 aa  87  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0249858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1597  hypothetical protein  39.5 
 
 
763 aa  74.7  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2220  hypothetical protein  33.54 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122347  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3430  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  63.9  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1997  hypothetical protein  32.09 
 
 
154 aa  45.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  26.38 
 
 
2914 aa  45.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>