22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2588 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2433  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  87.96 
 
 
916 aa  1566    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4205  Lantibiotic dehydratase domain protein  44.49 
 
 
937 aa  689    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.254357  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  48.44 
 
 
904 aa  731    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2588  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  100 
 
 
919 aa  1828    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233589  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0922  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.38 
 
 
895 aa  158  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0550  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.25 
 
 
858 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13765  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1490  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.1 
 
 
897 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3861  Lantibiotic dehydratase domain protein  27.23 
 
 
817 aa  101  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4196  hypothetical protein  25.76 
 
 
853 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5328  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.66 
 
 
851 aa  91.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4231  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.77 
 
 
962 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  27.2 
 
 
757 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.14 
 
 
1148 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.67 
 
 
1055 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.41 
 
 
1060 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3045  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  33.33 
 
 
811 aa  51.2  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3271  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.19 
 
 
811 aa  48.9  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628325  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3046  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.33 
 
 
761 aa  48.5  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0356  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.28 
 
 
778 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228849  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3272  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.35 
 
 
761 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42354  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.35 
 
 
1038 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4346  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.09 
 
 
769 aa  44.3  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851094  normal  0.758977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>