17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2209 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  87.86 
 
 
280 aa  507  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  64.62 
 
 
287 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  63.54 
 
 
289 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  64.86 
 
 
289 aa  352  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  63.44 
 
 
343 aa  346  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  49.28 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  47.37 
 
 
298 aa  252  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  44.24 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  34.62 
 
 
259 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  35.61 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  35.38 
 
 
265 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  28 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  25.41 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1260  hypothetical protein  22.38 
 
 
266 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0689  hypothetical protein  25.98 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4656  hypothetical protein  26.56 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>