23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0603 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 
420 aa  826    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  54.72 
 
 
436 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  48.7 
 
 
405 aa  307  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  48.64 
 
 
381 aa  302  9e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  49.7 
 
 
399 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  47.18 
 
 
358 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  47.41 
 
 
412 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  42.08 
 
 
367 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  43.72 
 
 
390 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  47.91 
 
 
408 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  45.45 
 
 
395 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  42.57 
 
 
412 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  51.55 
 
 
242 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  37.62 
 
 
409 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  36.1 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  44.25 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  35.19 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  28.95 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  24.8 
 
 
414 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  21.99 
 
 
409 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  27.93 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  26.5 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3397  Lanthionine synthetase C family protein  21.85 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.741439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>