More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0165 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
376 aa  762    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  90.19 
 
 
377 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  42.15 
 
 
378 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  34.66 
 
 
399 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  32.59 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  32.33 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  31.81 
 
 
397 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  31.81 
 
 
397 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  32.17 
 
 
401 aa  195  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  33.61 
 
 
391 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  30.98 
 
 
393 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  36.21 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  33.05 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  27.69 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  26.61 
 
 
411 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  28.23 
 
 
411 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  26.61 
 
 
411 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 
411 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  26.61 
 
 
411 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  26.61 
 
 
411 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  26.61 
 
 
411 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  33.93 
 
 
433 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  25.28 
 
 
438 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 
397 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.61 
 
 
447 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 
428 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.48 
 
 
391 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.48 
 
 
391 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 
393 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.91 
 
 
431 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.91 
 
 
431 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 
391 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.91 
 
 
431 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.38 
 
 
431 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.87 
 
 
383 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 
435 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 
435 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 
435 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.95 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.95 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.51 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  30.54 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 
431 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.51 
 
 
394 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 
444 aa  93.6  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  26.27 
 
 
440 aa  90.5  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 
407 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 
436 aa  89.4  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 
407 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  30.99 
 
 
398 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  30.99 
 
 
398 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  32.04 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  30.99 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  22.25 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  22.25 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  24.71 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  28.46 
 
 
723 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  30.41 
 
 
398 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  30.41 
 
 
398 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  19.67 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  21.47 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  21.47 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  21.47 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  21.47 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  21.47 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.39 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.7 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.7 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.7 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  33.99 
 
 
457 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.23 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  22.32 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
800 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  27.93 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 
476 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  36.43 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  35.51 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  28.94 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  27.81 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  27.81 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  22.52 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  24.72 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>