20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3323 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3323  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  203  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0047643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4062  hypothetical protein  65.31 
 
 		 110 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.129489  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4155  hypothetical protein  64.29 
 
 		 110 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4037  hypothetical protein  64.29 
 
 		 110 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3960  hypothetical protein  64.29 
 
 		 110 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3840  hypothetical protein  63.92 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0300  hypothetical protein  63.92 
 
 		 101 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3658  hypothetical protein  65.26 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3644  hypothetical protein  62.89 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.375921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0331  hypothetical protein  63.16 
 
 		 101 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0283  hypothetical protein  61.62 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000469346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0309  hypothetical protein  58.95 
 
 		 98 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0408  hypothetical protein  54.08 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.392247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0398  hypothetical protein  59.57 
 
 		 97 aa  120  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.980597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0263  hypothetical protein  57.89 
 
 		 101 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151206  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4195  hypothetical protein  53.61 
 
 		 97 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002093  aminopeptidase N  43.42 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00343  hypothetical protein  43.42 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0225  hypothetical protein  42.47 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2577  hypothetical protein  41.03 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00169793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>