17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2552 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0715  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  45.95 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3151  OmpA domain-containing protein  48.19 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0816  OmpA domain-containing protein  48.19 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0823  OmpA domain-containing protein  46.24 
 
 		 191 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.961285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0787  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  48.19 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3596  OmpA domain-containing protein  45.41 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.863386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3719  OmpA domain-containing protein  45.41 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3527  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  44.86 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3810  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  45.11 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3630  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  42.86 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3437  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  35.11 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3640  OmpA domain-containing protein  34.22 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.750133  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000761  OmpA-like transmembrane domain protein  28.57 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0698  hypothetical protein  28.98 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04884  hypothetical protein  30.34 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3816  OmpA domain-containing protein  28.82 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.549731  normal  0.0255224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>