22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2323 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  100 
 
 
144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  53.28 
 
 
157 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  49.29 
 
 
141 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  52.31 
 
 
141 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  47.86 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  47.86 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  47.14 
 
 
141 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  47.86 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  47.14 
 
 
141 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  47.86 
 
 
141 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  47.86 
 
 
141 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  47.86 
 
 
141 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  45.71 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  46.72 
 
 
141 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  46.43 
 
 
141 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  46.32 
 
 
141 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  35.04 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  34.15 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  31.39 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  32.52 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  30.08 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  30 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>