16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0851 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0851  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  329  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.403973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2878  hypothetical protein  72.39 
 
 
163 aa  254  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00543287  hitchhiker  0.000193701 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2960  hypothetical protein  72.39 
 
 
163 aa  253  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.373099  hitchhiker  0.00896796 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3056  hypothetical protein  71.78 
 
 
163 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469706  normal  0.0518674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1172  hypothetical protein  70.55 
 
 
163 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0188843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1249  hypothetical protein  70.55 
 
 
163 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3141  hypothetical protein  70.55 
 
 
163 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335339  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1318  hypothetical protein  71.25 
 
 
163 aa  248  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1216  hypothetical protein  69.94 
 
 
163 aa  247  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1130  hypothetical protein  77.62 
 
 
153 aa  244  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.165556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1213  hypothetical protein  68.79 
 
 
158 aa  240  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1111  hypothetical protein  67.52 
 
 
159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1023  hypothetical protein  67.31 
 
 
159 aa  230  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0997  hypothetical protein  67.76 
 
 
159 aa  227  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2805  hypothetical protein  61.15 
 
 
157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2970  hypothetical protein  57.59 
 
 
158 aa  202  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>