21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0806 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0806  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1380  hypothetical protein  52.15 
 
 
252 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2992  hypothetical protein  52.15 
 
 
211 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1274  hypothetical protein  51.2 
 
 
211 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.296319  normal  0.0271731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2812  hypothetical protein  51.67 
 
 
211 aa  231  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2895  hypothetical protein  51.67 
 
 
211 aa  231  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3103  hypothetical protein  51.2 
 
 
211 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.655316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3246  hypothetical protein  50.72 
 
 
211 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3093  hypothetical protein  50.72 
 
 
211 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1193  hypothetical protein  49.28 
 
 
211 aa  224  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0918  hypothetical protein  49.28 
 
 
212 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000705912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1093  hypothetical protein  48.8 
 
 
210 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0933  hypothetical protein  47.87 
 
 
214 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0948  hypothetical protein  46.41 
 
 
210 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1021  hypothetical protein  47.8 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0734575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0884  hypothetical protein  49 
 
 
202 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1813  hypothetical protein  30.92 
 
 
220 aa  104  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1239  hypothetical protein  29.81 
 
 
219 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00149837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003779  hypothetical protein  28.84 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02653  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2020  hypothetical protein  25.82 
 
 
229 aa  85.9  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>