66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1729 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  51.87 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  50.27 
 
 		 186 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  39.33 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  29.67 
 
 		 175 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  34.13 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  28.81 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  28.32 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  31.68 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  28.07 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  29.31 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  29.52 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  27.49 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  27.49 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  31.87 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  28.07 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  28.07 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  28.07 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  29.94 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  32.95 
 
 		 179 aa  72  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  29.24 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  26.9 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  25.73 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  25.29 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  28.95 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  28.07 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  26.32 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  26.9 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  34.55 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  26.86 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  24.86 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  30.12 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  25.15 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  28.73 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  26.88 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  26.63 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  30.82 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  26.06 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  27.78 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  26.16 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  26.99 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  28.16 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  26.82 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  36.19 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  27.37 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  25.7 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  25.28 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  32.04 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  43.84 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  25.43 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  33.12 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  25.28 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  40.2 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  40.2 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  30.67 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  25.14 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  27.52 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  26.4 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  35.14 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  38.75 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  38.75 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  24.24 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  29.31 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  29.13 
 
 		 178 aa  45.1  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  30.86 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>