32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1461 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  728    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0143143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1817  hypothetical protein  32.11 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0108  hypothetical protein  29.09 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2562  hypothetical protein  24.04 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1879  hypothetical protein  25.35 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2221  hypothetical protein  30.88 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2248  hypothetical protein  24.04 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.284315  normal  0.730008 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4359  hypothetical protein  23.1 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0167  hypothetical protein  26.4 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3313  hypothetical protein  26.37 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07920  uncharacterized membrane protein  26.32 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2507  transporter  28.93 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3490  hypothetical protein  24.04 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0707746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0081  hypothetical protein  24.83 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00405626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2010  hypothetical protein  27.6 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2710  hypothetical protein  25.81 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210144  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12490  uncharacterized membrane protein  25.73 
 
 		 459 aa  53.5  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3295  hypothetical protein  21.7 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1870  hypothetical protein  21.84 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2046  hypothetical protein  21.84 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00084703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2014  hypothetical protein  21.7 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.85804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1824  hypothetical protein  21.84 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2012  hypothetical protein  21.84 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1840  hypothetical protein  21.99 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1765  hypothetical protein  23.86 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4945  hypothetical protein  24.53 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000030592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2125  hypothetical protein  21.99 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.586239  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25260  uncharacterized membrane protein  23.36 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.461148  normal  0.040821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1874  hypothetical protein  21.7 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2091  hypothetical protein  21.99 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.295909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1519  hypothetical protein  20.82 
 
 		 347 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2232  hypothetical protein  26.34 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>