17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0582 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  767    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  40.23 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  43.07 
 
 		 343 aa  225  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  27.75 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  31.72 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  24.57 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  22.63 
 
 		 322 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  24.46 
 
 		 280 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  23.66 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  31.62 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  32.09 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  21.6 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  21.23 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  34.67 
 
 		 233 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  31.87 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>