17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3526 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3526  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  303  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1162  type IV pilus assembly protein PilX  84.97 
 
 		 153 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3229  hypothetical protein  84.31 
 
 		 153 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1060  type IV pilus assembly protein PilX  84.31 
 
 		 153 aa  262  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1127  type IV pilus assembly protein PilX  83.66 
 
 		 153 aa  259  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3130  type IV pilus assembly protein PilX  81.05 
 
 		 153 aa  254  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.706597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1065  type IV pilus assembly protein PilX  62.75 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3033  type IV pilus assembly protein PilX  59.09 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0930  type IV pilus assembly protein PilX  60.65 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.881011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1200  type IV pilus assembly protein PilX  58.82 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2951  type IV pilus assembly protein PilX  57.86 
 
 		 150 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.114107  normal  0.117946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1297  type IV pilus assembly protein PilX  55.84 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1105  type IV pilus assembly protein PilX  57.52 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.711381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1089  type IV pilus assembly protein PilX  52.9 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2884  type IV pilus assembly protein PilX  53.33 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2717  type IV pilus assembly protein PilX  53.25 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1215  hypothetical protein  27.22 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>