12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4760 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4760  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4795  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4686  hypothetical protein  49.1 
 
 
385 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147095  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4687  hypothetical protein  37.72 
 
 
497 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268272  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4761  hypothetical protein  35.08 
 
 
462 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4796  hypothetical protein  35.08 
 
 
462 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4155  hypothetical protein  33.91 
 
 
670 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4324  putative lipoprotein  34.94 
 
 
492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4323  hypothetical protein  34.02 
 
 
437 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4029  hypothetical protein  33.82 
 
 
441 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4030  putative lipoprotein  33.13 
 
 
489 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4459  hypothetical protein  49.3 
 
 
144 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>