18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2977 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



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Replicon accession

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2977  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2893  Mig-14  99.33 
 
 
298 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3080  Mig-14  98.99 
 
 
298 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2958  hypothetical protein  98.99 
 
 
298 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127053  hitchhiker  0.0000324409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2924  Mig-14  97.99 
 
 
298 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0097  Mig-14 family protein  56.67 
 
 
302 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028214  hitchhiker  0.0000000164486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1493  Mig-14 family protein  41.24 
 
 
296 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.66727  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0475  Mig-14  27.53 
 
 
298 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.496349  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4814  Mig-14 family protein  26.48 
 
 
298 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4942  Mig-14 family protein  26.13 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4991  Mig-14 family protein  26.13 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0526  Mig-14 family protein  25.78 
 
 
298 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254564  normal  0.164159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5738  hypothetical protein  25.78 
 
 
298 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66150  hypothetical protein  25.44 
 
 
298 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4990  hypothetical protein  24.91 
 
 
298 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0530  Mig-14  25 
 
 
298 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0825509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0595  Mig-14 family protein  23.08 
 
 
298 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012560  Avin_44700  Mig-14 family protein  22.54 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.390095  n/a   
 
 
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