59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0704 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  99.49 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  80.1 
 
 		 193 aa  318  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  79.59 
 
 		 193 aa  316  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  78.57 
 
 		 193 aa  314  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  78.57 
 
 		 193 aa  314  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  78.57 
 
 		 193 aa  314  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  78.57 
 
 		 193 aa  314  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  78.57 
 
 		 193 aa  314  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  78.57 
 
 		 193 aa  314  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  78.57 
 
 		 193 aa  314  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  69.44 
 
 		 189 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  68 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  58.47 
 
 		 184 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  56.99 
 
 		 184 aa  218  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  52.6 
 
 		 182 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  55.35 
 
 		 184 aa  197  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  49.72 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  49.72 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  49.72 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  37.42 
 
 		 164 aa  121  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  34.16 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  35.06 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  34.16 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  34.16 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  34.19 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  36.54 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  38.92 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  33.77 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  33.77 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  39.88 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  33.77 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  33.12 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  36.78 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  35.03 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  33.95 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  33.33 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  35.03 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  32.26 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  30.25 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  32.7 
 
 		 167 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  33.9 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  28.39 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  26.25 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  26.25 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  28.95 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  29.68 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  26.79 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  23.6 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2916  rare lipoprotein B precursor  32.81 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  25 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0672  hypothetical protein  25.55 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00531564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1507  rare lipoprotein B precursor  24.77 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0236353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  31.07 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  24.22 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>