24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2273 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2273  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  222  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5344  hypothetical protein  42.72 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5609  hypothetical protein  42.72 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  hitchhiker  3.0871499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5020  hypothetical protein  42.72 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000313443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4910  hypothetical protein  41.75 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000107796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4925  hypothetical protein  41.75 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5466  hypothetical protein  41.75 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000127889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5401  hypothetical protein  41.75 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5318  hypothetical protein  41.75 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4457799999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5078  hypothetical protein  41.75 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5350  hypothetical protein  41.75 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000116782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0669  hypothetical protein  38.24 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3663  hypothetical protein  33.65 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.966018  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1531  hypothetical protein  35.24 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.518007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1489  hypothetical protein  34.62 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1646  hypothetical protein  33.65 
 
 
105 aa  57  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1499  hypothetical protein  33.65 
 
 
105 aa  57  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00791451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1712  hypothetical protein  33.65 
 
 
105 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1527  hypothetical protein  33.65 
 
 
105 aa  57  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1735  hypothetical protein  32.69 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00270412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1681  hypothetical protein  32.69 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1789  hypothetical protein  32.69 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3173  hypothetical protein  31.78 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1664  hypothetical protein  33.85 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>