28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0679 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0679  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  397  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1152  hypothetical protein  54.33 
 
 
208 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.779915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1174  hypothetical protein  54.33 
 
 
208 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4101  putative lipoprotein  29.74 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3906  putative lipoprotein  27.5 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.786194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4211  putative lipoprotein  27.5 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00435246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4013  putative lipoprotein  27.5 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3738  hypothetical protein  27.5 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000248645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2698  putative lipoprotein  27.59 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000263443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3754  hypothetical protein  27.5 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4118  putative lipoprotein  27.5 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1138  putative lipoprotein  28.44 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00766131  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4046  putative lipoprotein  27 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0207407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3825  hypothetical protein  29.91 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.357333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1501  putative lipoprotein  28.28 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000364833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4660  putative lipoprotein  26.26 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5591  putative lipoprotein  26.26 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1841  hypothetical protein  28.22 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000148442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3349  putative lipoprotein  28.22 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194548  hitchhiker  0.00000000000000618493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2081  putative lipoprotein  28.83 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1980  putative lipoprotein  28.22 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2013  putative lipoprotein  28.83 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1321099999999997e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2062  putative lipoprotein  28.83 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000994454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1978  putative lipoprotein  28.83 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0388658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1792  lipoprotein  28.83 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1809  lipoprotein  28.83 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.60974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1835  putative lipoprotein  28.83 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000721758  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0951  hypothetical protein  23.31 
 
 
211 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0419067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>