72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0235 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0235  putative heme peroxidase  100 
 
 
249 aa  520  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0625  putative heme peroxidase  80.72 
 
 
250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0610  putative heme peroxidase  80.72 
 
 
250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3909  putative heme peroxidase  60.24 
 
 
247 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5181  putative heme peroxidase  57.83 
 
 
247 aa  324  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5517  putative heme peroxidase  57.43 
 
 
247 aa  323  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5239  putative heme peroxidase  57.43 
 
 
247 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5069  putative heme peroxidase  57.43 
 
 
247 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5086  putative heme peroxidase  57.43 
 
 
247 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5637  putative heme peroxidase  57.43 
 
 
247 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5440  putative heme peroxidase  57.43 
 
 
247 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5511  putative heme peroxidase  57.43 
 
 
247 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5567  putative heme peroxidase  57.43 
 
 
247 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5483  putative heme peroxidase  57.03 
 
 
247 aa  322  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3365  putative heme peroxidase  57.83 
 
 
248 aa  321  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0342697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3473  putative heme peroxidase  59.44 
 
 
249 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2193  Chlorite dismutase  45.45 
 
 
520 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.242985  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1765  Chlorite dismutase  43.44 
 
 
250 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1222  hypothetical protein  38.49 
 
 
699 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1250  hypothetical protein  39.13 
 
 
685 aa  211  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249744  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2033  Chlorite dismutase  44.13 
 
 
250 aa  210  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145624  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3475  Chlorite dismutase  38.96 
 
 
518 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1955  putative heme peroxidase  38.58 
 
 
271 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1506  Chlorite dismutase  39.48 
 
 
517 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3790  Chlorite dismutase  32.3 
 
 
279 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1843  Chlorite dismutase  46.04 
 
 
235 aa  135  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2827  Chlorite dismutase  25.66 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5173  chlorite dismutase  24.88 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000990081  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2623  Chlorite dismutase  24.54 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2406  Chlorite dismutase  24.32 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  hitchhiker  0.00264181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1554  Chlorite dismutase  23.81 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1766  Chlorite dismutase  22.58 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000058609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1336  chlorite dismutase  24.27 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0486629  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2491  Chlorite dismutase  23.48 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1089  Chlorite dismutase  23.01 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1896  hypothetical protein  24.87 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1891  Chlorite dismutase  22.83 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.297673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08350  hypothetical protein  26.09 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3926  Chlorite dismutase  23.78 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2261  chlorite dismutase  21.93 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.267683  normal  0.0759914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26770  hypothetical protein  21.47 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.379251  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1885  Chlorite dismutase  26.09 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3917  chlorite dismutase  23.74 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.657436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0747  chlorite dismutase  24.44 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1534  chlorite dismutase  23 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962183  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6785  Chlorite dismutase  25.32 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.777367  normal  0.25282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12691  hypothetical protein  22.69 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.90726e-33  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2483  chlorite dismutase  22.58 
 
 
234 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.359511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2265  Chlorite dismutase  23.12 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.557365  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2260  chlorite dismutase  22.12 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24070  hypothetical protein  21.97 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84912  normal  0.0210051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2203  chlorite dismutase  22.12 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451724  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2214  chlorite dismutase  22.12 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1476  chlorite dismutase  23.47 
 
 
233 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166814  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0515  chlorite dismutase  24.51 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1380  chlorite dismutase  23.53 
 
 
230 aa  62.4  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.138403  normal  0.465686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1894  Chlorite dismutase  22.11 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2769  chlorite dismutase  20.43 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0051176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3671  chlorite dismutase  22.42 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15210  hypothetical protein  20.77 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2990  Chlorite dismutase  27.27 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1546  Chlorite dismutase  21.55 
 
 
239 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.18455  normal  0.203099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6718  hypothetical protein  21.56 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15650  hypothetical protein  24.32 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.228607  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1587  Chlorite dismutase  22.16 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06265  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0151  Chlorite dismutase  22.6 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1404  Chlorite dismutase  27.11 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288752 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1710  chlorite dismutase  22.07 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1747  chlorite dismutase  27.1 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127686  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3545  chlorite dismutase  23.38 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.84719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2027  chlorite dismutase  30.86 
 
 
233 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0723  chlorite dismutase  27.34 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.996337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>