19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1555 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1555  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0170408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1407  hypothetical protein  38.64 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2178  hypothetical protein  33.18 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1141  hypothetical protein  34.09 
 
 
228 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0173277  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1595  hypothetical protein  30.32 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00605594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1304  hypothetical protein  32.73 
 
 
224 aa  118  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.795946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0701  hypothetical protein  33.48 
 
 
224 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0249  hypothetical protein  30.04 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4918  hypothetical protein  29.52 
 
 
299 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1815  VTC domain protein  26.22 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2978  hypothetical protein  29.15 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3169  hypothetical protein  29.91 
 
 
280 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  25.33 
 
 
282 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0240  hypothetical protein  26.91 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.659958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2305  hypothetical protein  27.39 
 
 
242 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0374  hypothetical protein  24.9 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4795  VTC domain protein  24.31 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2816  hypothetical protein  25.69 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.850496  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13170  VTC domain-containing protein  25.99 
 
 
284 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.733284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>