21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1817 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1817  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  767    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1461  hypothetical protein  31.94 
 
 
378 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0143143  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0108  hypothetical protein  27.84 
 
 
371 aa  89.7  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0108219  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0677  hypothetical protein  24.62 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.202663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0692  hypothetical protein  24.62 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0235088  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1518  hypothetical protein  24.08 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.913415  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0308  hypothetical protein  23.49 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3313  hypothetical protein  24.36 
 
 
351 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0167  hypothetical protein  26.39 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4359  hypothetical protein  23.86 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12490  uncharacterized membrane protein  26.25 
 
 
459 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2562  hypothetical protein  24.78 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4945  hypothetical protein  20.98 
 
 
343 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000030592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2221  hypothetical protein  31.39 
 
 
361 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1765  hypothetical protein  26.61 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07920  uncharacterized membrane protein  24.85 
 
 
385 aa  49.7  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0643  hypothetical protein  21.84 
 
 
357 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2507  transporter  26.41 
 
 
341 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2565  hypothetical protein  23.1 
 
 
350 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2232  hypothetical protein  25.49 
 
 
349 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3295  hypothetical protein  20.58 
 
 
346 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>