77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0421 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0421  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  138  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.849917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1939  protein of unknown function DUF466  51.56 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294211  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1573  hypothetical protein  54.1 
 
 
61 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.197269  normal  0.788025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0335  protein of unknown function DUF466  54.24 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08620  uncharacterized small protein  45.9 
 
 
81 aa  57.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0645  hypothetical protein  48.98 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0861404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16570  uncharacterized small protein  44.62 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15000  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344355  normal  0.519615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0832  hypothetical protein  46.94 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.619207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0098  hypothetical protein  38.71 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2309  protein of unknown function DUF466  39.06 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163671  hitchhiker  0.00083492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0654  hypothetical protein  38.71 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0713  hypothetical protein  38.71 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.885775  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0759  hypothetical protein  38.71 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0640  hypothetical protein  38.71 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0697  hypothetical protein  38.71 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3246  hypothetical protein  37.1 
 
 
68 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710671  normal  0.40045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5299  hypothetical protein  37.1 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4711  hypothetical protein  37.1 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3726  protein of unknown function DUF466  38.89 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5433  hypothetical protein  37.1 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1131  hypothetical protein  37.1 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2938  hypothetical protein  38.6 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.888037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3064  hypothetical protein  38.6 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4227  hypothetical protein  44.64 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2251  hypothetical protein  37.1 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0684  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0650  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3403  protein of unknown function DUF466  38.89 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0619  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00555  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3026  protein of unknown function DUF466  37.1 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00566  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559075  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3045  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0501  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0619  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.593991  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0023  hypothetical protein  38.89 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104955  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4893  hypothetical protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4879  hypothetical protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04185  hypothetical protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5865  hypothetical protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3713  hypothetical protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828713  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04219  hypothetical protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3644  protein of unknown function DUF466  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4323  hypothetical protein  46.51 
 
 
45 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4573  hypothetical protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4945  hypothetical protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3362  protein of unknown function DUF466  40.82 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.280192  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6472  hypothetical protein  37.5 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal  0.210548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1797  hypothetical protein  46.51 
 
 
45 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13548  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1844  hypothetical protein  46.51 
 
 
45 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.598922  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1778  hypothetical protein  46.51 
 
 
45 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380449  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3416  hypothetical protein  34.43 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.700053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1293  hypothetical protein  39.29 
 
 
785 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0510  hypothetical protein  37.5 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0561184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4885  hypothetical protein  36.21 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4858  hypothetical protein  36.21 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4937  hypothetical protein  36.21 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.793617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4944  hypothetical protein  36.21 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.786101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4784  hypothetical protein  36.21 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244344  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1090  hypothetical protein  35.71 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.926383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0581  hypothetical protein  35.71 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3106  protein of unknown function DUF466  39.29 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1187  protein of unknown function DUF466  34.92 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00439042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3225  protein of unknown function DUF466  35.71 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0370622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3573  hypothetical protein  32.79 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0682  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.643858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3981  protein of unknown function DUF466  41.67 
 
 
68 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2293  protein of unknown function DUF466  34.92 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2016  hypothetical protein  34.92 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1978  protein of unknown function DUF466  34.38 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89356  normal  0.275642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4502  hypothetical protein  35.48 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.594956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4640  hypothetical protein  35.48 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4634  hypothetical protein  35.48 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127286  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0071  hypothetical protein  42.5 
 
 
66 aa  40.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.402388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2628  hypothetical protein  36.67 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1262  hypothetical protein  31.75 
 
 
83 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>