65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4345 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  345  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  43.14 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  33.99 
 
 
146 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  36.42 
 
 
142 aa  97.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  33.33 
 
 
146 aa  94  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  37.75 
 
 
142 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  39.67 
 
 
146 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  38.02 
 
 
146 aa  88.2  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  30.07 
 
 
157 aa  87.4  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  40 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  35.03 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  31.17 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  34.75 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  30.32 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  35.9 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  26 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  33.61 
 
 
141 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  32.77 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  31.11 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  31.58 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  34.43 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  30.51 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  34.97 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  34.96 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  33.05 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  30.51 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  30.26 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  33.58 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  28.48 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  36.75 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  27.15 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  31.15 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  29.66 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  35.43 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  28 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  37.1 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  33.77 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  30.51 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  32.54 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  33.77 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  31.85 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  32.48 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  29.56 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  26.32 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  31.03 
 
 
154 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  31.93 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  30.83 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.27 
 
 
148 aa  61.6  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  28.68 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  31.62 
 
 
151 aa  60.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  33.61 
 
 
152 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  26.22 
 
 
194 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  25.17 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  27.05 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  28.33 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  31.15 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  24.6 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  24.6 
 
 
154 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  27.69 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3649  hypothetical protein  22.83 
 
 
310 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  27.13 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  23.75 
 
 
174 aa  40.8  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>