78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4343 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  291  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  42.45 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  43.97 
 
 
146 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  42.65 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  39.39 
 
 
146 aa  103  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  42.54 
 
 
146 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  40.58 
 
 
147 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  39.86 
 
 
144 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  39.2 
 
 
142 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  41.13 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  37.23 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  37.96 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  36.62 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  37.93 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  35.77 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  31.16 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  35.71 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  36.88 
 
 
146 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  37.41 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  36.43 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  37.14 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  39.2 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  28.47 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  34.53 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  33.33 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  31.17 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  34.11 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  32.88 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  39.31 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  32.59 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  38.73 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  30.46 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  29.37 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  29.17 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  31.21 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  31.29 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  31.11 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  31.62 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  28.87 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  29.58 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  28.87 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  30.6 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  30.87 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  32.82 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  32.17 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  32.17 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  29.79 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  31.47 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  27.33 
 
 
178 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  25.52 
 
 
174 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.74 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  28.57 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  30.08 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  30.56 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  28.15 
 
 
147 aa  58.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  26.87 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  27.86 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  29.92 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  32.54 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  28.15 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  30.08 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  28.15 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  29.71 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  25.69 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  26.49 
 
 
167 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1129  hypothetical protein  25 
 
 
169 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  21.58 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3657  hypothetical protein  26.23 
 
 
301 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111634  hitchhiker  0.00478101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  29.55 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  24.32 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  25.35 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2563  hypothetical protein  24.11 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00285487  hitchhiker  0.0000000213199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  25.56 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  23.58 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>