12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4234 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4234  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.877652 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4220  hypothetical protein  28.22 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0919371  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4304  hypothetical protein  28.22 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4382  hypothetical protein  28.22 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0603104  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4602  hypothetical protein  28.22 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1175  transposition protein TniQ  28.49 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3008  hypothetical protein  27.78 
 
 		 405 aa  46.2  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4043  transposon related protein TniQ (Tn6048)  27.78 
 
 		 405 aa  46.2  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705627  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4974  transposon related protein TniQ (Tn6048)  27.78 
 
 		 405 aa  46.2  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39202  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3577  TniQ family protein  26.06 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0706835  hitchhiker  0.00685617 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  29.79 
 
 		 849 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  29.79 
 
 		 849 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>