12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2080 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1320  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  240  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2080  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  240  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4257  hypothetical protein  55.45 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1226  hypothetical protein  59.79 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0103498  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0448  hypothetical protein  42.45 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2256  hypothetical protein  38.21 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2191  hypothetical protein  37.65 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0458  hypothetical protein  37.93 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.291387  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1034  hypothetical protein  26 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2349  hypothetical protein  25.53 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1730  hypothetical protein  27.93 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2388  hypothetical protein  22.64 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00873498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>