32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1980 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  52.06 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  41.36 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  46.75 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  38.37 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  45.08 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  42.77 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  37.25 
 
 		 361 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  35.74 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  35.74 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  40.54 
 
 		 349 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  34.43 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  31.78 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  39.01 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  33.44 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.89 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  36.28 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 779 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.19 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  32.41 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  31.66 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  31.66 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  29.7 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  30.34 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.14 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  30.21 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  28.16 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  32.26 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  26.02 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  36.61 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1444  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.54 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>