42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1855 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  39.6 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  42.7 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  42.19 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  36.23 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  42.5 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  35.98 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  33.51 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  37.69 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  34.5 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  34.5 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  34.12 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  30.2 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  40.17 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  38.33 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  38.33 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  39.81 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  31.48 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  23.75 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  28.21 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  24.85 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  25.61 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  34.12 
 
 		 159 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  28.48 
 
 		 162 aa  49.3  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  28.29 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  30.67 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  30.67 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  23.27 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  29.73 
 
 		 147 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  26.12 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  27.69 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  29.05 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  28.47 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  28.12 
 
 		 160 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  31.76 
 
 		 180 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  32.63 
 
 		 176 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>