11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2349 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2349  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  249  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0205  hypothetical protein  39.73 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0613487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2388  hypothetical protein  25.96 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00873498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2191  hypothetical protein  28.04 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1730  hypothetical protein  25.93 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0458  hypothetical protein  32.35 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.291387  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1320  hypothetical protein  25.53 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2080  hypothetical protein  25.53 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2075  hypothetical protein  25.38 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000061311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4257  hypothetical protein  24.74 
 
 		 113 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1034  hypothetical protein  25.51 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>