11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1806 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1806  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  276  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.637829 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5358  hypothetical protein  92.55 
 
 		 95 aa  159  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5030  copper/silver resistance protein CusD  48.53 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.324306  normal  0.155769 
 
 
-
 
NC_003296  RS05408  hypothetical protein  53.73 
 
 		 136 aa  120  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6133  copper/silver resistance transmembrane protein SilD  46.1 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.437215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1649  hypothetical protein  48.25 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5290  hypothetical protein  46.32 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1624  hypothetical protein  36.09 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0476  hypothetical protein  33.54 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4510  hypothetical protein  29.27 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3494  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>