19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0426 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  69.95 
 
 		 185 aa  257  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  40.22 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2964  hypothetical protein  40.54 
 
 		 190 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  40.44 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  38.25 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  42.29 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  42.29 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  42.29 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  38.51 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  38.51 
 
 		 219 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  32 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3494  hypothetical protein  29.89 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  29.63 
 
 		 455 aa  68.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0328  hypothetical protein  30.65 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1465  hypothetical protein  27.68 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70220  hypothetical protein  48.15 
 
 		 63 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0165  hypothetical protein  32.47 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>