12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4454 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4454  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327935  normal  0.0437667 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6792  hypothetical protein  72.93 
 
 
229 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2740  hypothetical protein  50.71 
 
 
220 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.286647  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5046  hypothetical protein  47.62 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776863  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5814  hypothetical protein  47.62 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4365  hypothetical protein  47.62 
 
 
224 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6835  hypothetical protein  47.96 
 
 
229 aa  181  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446166  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6397  hypothetical protein  44.04 
 
 
220 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.933792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2809  hypothetical protein  44.1 
 
 
241 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6827  hypothetical protein  43.01 
 
 
232 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0370617  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2896  hypothetical protein  37.74 
 
 
229 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6574  hypothetical protein  41.94 
 
 
82 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>