40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3094 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



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Replicon accession
Locus tag
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3094  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 108 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3441  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 108 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5694  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  81.48 
 
 		 108 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6225  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  77.78 
 
 		 108 aa  183  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7247  ethyl tert-butyl ether degradation protein, EthD  73.83 
 
 		 108 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.229987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5990  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  73.15 
 
 		 108 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2087  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  73.15 
 
 		 108 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4718  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  74.76 
 
 		 104 aa  164  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2106  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  72.9 
 
 		 108 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.217375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1972  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  71.96 
 
 		 108 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.906613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00821  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  64.08 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0976137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1877  EthD  54.46 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2068  hypothetical protein  53.47 
 
 		 109 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0707  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  55.88 
 
 		 104 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0206  normal  0.431639 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5978  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  52.43 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2708  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  49.5 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5139  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  46.08 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249739  hitchhiker  0.00632638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3870  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  42.06 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2223  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  42.16 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0881  hypothetical protein  47.25 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3112  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  47.25 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0608  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  46.15 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0686  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  44.66 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1640  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  43.14 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3503  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.31 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0177  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  39.22 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2764  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  46.53 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3594  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  41.58 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1013  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  39.22 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_4538  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  44.12 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4472  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  42.57 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2867  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  48.08 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2641  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  48.08 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2334  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.95 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00612684  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0215  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.41 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3458  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.95 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3681  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  39.6 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401382 
 
 
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NC_009952  Dshi_2482  hypothetical protein  30.69 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_0769  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.31 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6287  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.99 
 
 		 102 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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