12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0924 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0924  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638112  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0859  Tetratricopeptide TPR_4  97.62 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0994  hypothetical protein  85.71 
 
 		 252 aa  421  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2498  hypothetical protein  64.61 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0034451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1986  putative transmembrane protein  56.28 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1540  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1662  tetratricopeptide TPR_4  35.74 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.399527  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3734  hypothetical protein  30.67 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4769  hypothetical protein  30.67 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0665  tetratricopeptide TPR_4  35.88 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0637  tetratricopeptide TPR_4  26.32 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4035  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>