30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0678 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0678  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.450088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2191  hypothetical protein  81.3 
 
 		 136 aa  204  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2389  hypothetical protein  78.12 
 
 		 136 aa  202  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0953  hypothetical protein  80.49 
 
 		 136 aa  199  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4174  hypothetical protein  69.35 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950155  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1189  hypothetical protein  69.42 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1169  hypothetical protein  68.6 
 
 		 136 aa  176  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2854  hypothetical protein  67.94 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1403  hypothetical protein  67.77 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1261  hypothetical protein  67.77 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1631  hypothetical protein  65.12 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0440  hypothetical protein  70 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3419  hypothetical protein  66.94 
 
 		 136 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  0.0716917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2348  hypothetical protein  67.77 
 
 		 132 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000206285  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0507  hypothetical protein  74.8 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59890  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  121  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571428  hitchhiker  0.00000000000107847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4510  hypothetical protein  49.21 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3018  hypothetical protein  51.64 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1447  hypothetical protein  44.8 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36230  hypothetical protein  49.17 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2943  hypothetical protein  49.57 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3325  hypothetical protein  48.72 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0866  hypothetical protein  49.11 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1759  hypothetical protein  34.43 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0655  hypothetical protein  37.4 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3710  hypothetical protein  32.97 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4091  hypothetical protein  29.41 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4174  hypothetical protein  31.46 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0332  hypothetical protein  29.41 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.134237 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3931  hypothetical protein  30.66 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>