12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3317 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3317  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2903  hypothetical protein  69.15 
 
 		 202 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3468  hypothetical protein  36.82 
 
 		 198 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.671623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4923  hypothetical protein  40.3 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3582  hypothetical protein  41.29 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0327  hypothetical protein  32.34 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2068  hypothetical protein  32.34 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2536  hypothetical protein  21.58 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1408  hypothetical protein  28.35 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  0.630193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0328  hypothetical protein  26.24 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2067  hypothetical protein  26.24 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0220632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>