25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3240 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3240  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2832  hypothetical protein  65.69 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0471494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2801  hypothetical protein  62.93 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1114  hypothetical protein  62.34 
 
 		 111 aa  84  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.10293  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2935  hypothetical protein  59.42 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2463  hypothetical protein  55.56 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.042931  normal  0.181289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3037  hypothetical protein  51.25 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4117  hypothetical protein  61.29 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690981  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2115  hypothetical protein  55.56 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3723  hypothetical protein  55.88 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0432  hypothetical protein  57.14 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4631  hypothetical protein  53.73 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0537767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5556  hypothetical protein  53.23 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563792  hitchhiker  0.000681675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1530  hypothetical protein  56.45 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.010116  normal  0.139941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4264  hypothetical protein  52.24 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134049 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5850  hypothetical protein  45.31 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.980958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3681  hypothetical protein  55.38 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2504  hypothetical protein  55.17 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2201  hypothetical protein  46.48 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3817  hypothetical protein  46.67 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5198  hypothetical protein  45.9 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4549  hypothetical protein  45.9 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5643  hypothetical protein  43.24 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4309  hypothetical protein  44.26 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3741  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>