23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2256 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2256  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.690803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2109  hypothetical protein  77.73 
 
 		 238 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3332  hypothetical protein  76.05 
 
 		 238 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3239  hypothetical protein  58.12 
 
 		 234 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6065  hypothetical protein  58.67 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2717  hypothetical protein  57.59 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1441  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.364896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1328  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1149  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0955  NUDIX hydrolase  38.77 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2899  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0980  NUDIX hydrolase  34.89 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0220325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2672  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2794  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0671  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.338441  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1933  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1818  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1332  nudix hydrolase  28.96 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2774  hypothetical protein  31.65 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2477  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2731  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0380829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1375  hypothetical protein  25.34 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3658  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>