22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1259 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1259  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1241  hypothetical protein  88.51 
 
 		 87 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1126  hypothetical protein  85.06 
 
 		 87 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4329  hypothetical protein  76.19 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4017  hypothetical protein  75.9 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2702  hypothetical protein  75.61 
 
 		 88 aa  127  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0227124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2379  hypothetical protein  70.24 
 
 		 88 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1756  hypothetical protein  58.11 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.886984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0685  hypothetical protein  58.57 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3986  hypothetical protein  54.79 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00087868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1478  hypothetical protein  49.25 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4301  hypothetical protein  56.34 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.368926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4819  hypothetical protein  57.14 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  0.27545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4670  hypothetical protein  56.34 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0756  hypothetical protein  46.38 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0670  hypothetical protein  32.91 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0663  hypothetical protein  32.91 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2616  hypothetical protein  32.43 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363218  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1464  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1015  hypothetical protein  35.82 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737954  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0708  hypothetical protein  36.92 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1167  hypothetical protein  34.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>