22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0506 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0506  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0295  hypothetical protein  79.17 
 
 		 48 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0531  hypothetical protein  75 
 
 		 48 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568613  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7574  hypothetical protein  72.92 
 
 		 48 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0534  hypothetical protein  68.75 
 
 		 48 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0489  hypothetical protein  72.92 
 
 		 48 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0394  hypothetical protein  66.67 
 
 		 48 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.519448  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0678  hypothetical protein  52.27 
 
 		 50 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.825498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2511  hypothetical protein  53.33 
 
 		 50 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.238008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2439  hypothetical protein  53.33 
 
 		 50 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1133  hypothetical protein  51.11 
 
 		 50 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2734  hypothetical protein  51.11 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.25309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0908  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3406  hypothetical protein  52.5 
 
 		 48 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.178655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4054  hypothetical signal peptide protein  57.5 
 
 		 50 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0988003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2566  putative signal peptide protein  48.94 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1848  hypothetical protein  44.68 
 
 		 47 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3890  conserved hypothetical signal peptide protein  45.45 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124515  decreased coverage  0.00196238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3597  conserved hypothetical signal peptide protein  45.45 
 
 		 58 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2030  hypothetical protein  42.5 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1952  hypothetical protein  42.5 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3063  hypothetical protein  39.58 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>