16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4246 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4246  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  846    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111779  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0476  hypothetical protein  82.6 
 
 		 412 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1555  hypothetical protein  37.01 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0998  hypothetical protein  29.68 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6376  hypothetical protein  31.97 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12547  normal  0.702736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2098  conserved hypothetical alanine-rich protein  28.07 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000748992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1082  hypothetical protein  27.78 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109535  hitchhiker  0.00376234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1489  hypothetical protein  27.15 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5155  putative alanine-rich protein  26.09 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215555  normal  0.0173621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0478  hypothetical protein  32.24 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5105  hypothetical protein  32.11 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.967556  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0753  hypothetical protein  25.69 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1956  putative alanine-rich protein  26.58 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3556  hypothetical protein  26.36 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.394586  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4386  hypothetical protein  27.19 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4127  hypothetical protein  25 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>