10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4062 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4062  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  234  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3352  hypothetical protein  85.37 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2432  hypothetical protein  52.5 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.304675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3222  hypothetical protein  49.58 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0587  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_526  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000558785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06880  hypothetical protein  27.88 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0561  hypothetical protein  26.98 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0735  hypothetical protein  29.33 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2130  hypothetical protein  50 
 
 		 430 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>