22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1779 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  306  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  85.16 
 
 		 155 aa  257  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  33.99 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  32.03 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  33.99 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  35.04 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  30.92 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  34.29 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  34.75 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  36.6 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  30.26 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  32.61 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  40.71 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  34.75 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  29.08 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  32.62 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1109  hypothetical protein  37.9 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000177487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  27.92 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0746  hypothetical protein  33.99 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>