85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1660 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  100 
 
 		 142 aa  293  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  97.18 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  44.12 
 
 		 146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  41.13 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  42.31 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  40.15 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  41.79 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  36.09 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  39.72 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  38.52 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  37.75 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  36.17 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  39.52 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  36.43 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  35.71 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  36.81 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  36.3 
 
 		 150 aa  95.9  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  37.68 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  38.17 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  35.86 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  35.56 
 
 		 160 aa  94.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  32.59 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  32.39 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  35.21 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  34.81 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  36.72 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  32.37 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  35.66 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  31.69 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  35.97 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  32.84 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  34.81 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  35.59 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  34.09 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.91 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  37.86 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  33.09 
 
 		 157 aa  83.6  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  33.33 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  34.29 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  32.61 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  32.61 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  32.61 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  32.06 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  32.59 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  32.86 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  29.8 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  35.34 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  32.35 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  31.43 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  32.62 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  30.37 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  29.79 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  30.5 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  30.32 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  30.14 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  28.89 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  30.08 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  31.91 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  28.89 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  29.77 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  31.21 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  29.75 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  27.86 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  28.06 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  27.08 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  27.78 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  30.72 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  31.72 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  29.66 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  28.46 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  27.03 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3649  hypothetical protein  29.03 
 
 		 310 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  26.67 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  22.14 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1730  hypothetical protein  22.98 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000514392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  21.53 
 
 		 169 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1888  hypothetical protein  24.66 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0320965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3816  hypothetical protein  24.66 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0932  hypothetical protein  24.66 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0644252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>